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公司產品

RNAi對照

吉瑪可提供與目的基因序列無同源性的通用陰性對照和將選中的siRNA序列打亂(scrambled)的陰性對照

產品描述


吉瑪可以提供陰性和陽性siRNA對照

陰性對照: 通用對照(NC),固定序列,與人,大鼠,小鼠轉錄組比對無同源性。

? ? ? ? ? ? ? ? ?定制序列對照(scramble NC):?根據客戶提供siRNA序列打亂,與轉錄組比對無同源性。

陽性對照(部分基因):GAPDH,b-actin,GFP等


A. 陰性對照

吉瑪可提供與目的基因序列無同源性的通用陰性對照和將選中的siRNA序列打亂(scrambled)的陰性對照 1. siRNA實驗應該有陰性對照;
2. 通用陰性對照為與目的基因的序列無同源性的普通陰性對照;
3. Scrambled陰性對照和選中的siRNA序列有相同的組成,但是和mRNA沒有明顯的同源性;
4. 陰性對照需要確定和目的靶細胞中其它基因沒有同源性。


? ?
B. 熒光標記(FAM)的陰性對照
吉瑪可提供與目的基因序列無同源性的FAM標記的通用陰性對照 1. 通用陰性對照為與目的基因的序列無同源性的普通陰性對照;
2. 通過標記熒光,可以方便地在熒光顯微鏡下觀察轉染情況;
3. 可用于優化轉染條件和評價轉染效率;
4. 具備很好的pH耐受性,在活細胞中更穩定。

目錄號

產品名稱

規格

純化方式

價格

交貨期限

A06001

陰性對照siRNA

1 OD

HPLC

¥120

2個工作日

A07001

FAM標記陰性對照siRNA

1 OD

HPLC

¥150

2個工作日


C. 陽性對照

吉瑪公司可提供的常用的siRNA陽性對照

陽性對照作為一個實驗系統檢查是很重要的。也就是說,當您看到siRNA陽性對照的預期實驗結果時,您能確保在您的實驗方法中您的轉染、RNA提取物和檢測方法是可靠的

1. GFP-274

2. Luciferase GL2

3. GAPDHhuman/mouse/rat

4. β-actin (human/mouse/rat

5. P53

6. lamin A/C


目錄號

產品名稱

規格

純化方式

價格

交貨期限

A08001

陽性對照siRNA, LaminA/C

1 OD

HPLC

¥120

4個工作日

A08002

陽性對照siRNA, GFP274

1 OD

HPLC

¥120

2個工作日

A08003

陽性對照siRNA, Luciferase GL2

1 OD

HPLC

¥120

4個工作日

A08004

陽性對照siRNA, MAPK1

1 OD

HPLC

¥120

4個工作日

A08005

陽性對照siRNA, Beta-Actin

1 OD

HPLC

¥120

2個工作日

A08006

陽性對照siRNA, Vimentin

1 OD

HPLC

¥120

4個工作日

A08007

陽性對照siRNA, P53

1 OD

HPLC

¥120

2個工作日

A08008

陽性對照siRNA, GAPDH

1 OD

HPLC

¥120

2個工作日

A08009

陽性對照siRNA, Cyclophilin B

1 OD

HPLC

¥120

4個工作日


D. 轉染試劑對照

對于一個完善的對照系統,轉染試劑對照(Mock transfection )是不可缺的。轉染試劑對照可以檢測轉染試劑對細胞的毒性、細胞的成活率等細胞轉染的各個因素影響。

我們推薦使用我們公司最新的GenePharma轉染試劑 。(見轉染試劑)

目錄號

產品名稱

規格

價格

交貨期限

G04001

RNAi-Mate轉染試劑

0.1ml

150

2個工作日

G04002

siRNA-Mate轉染試劑

0.1ml

150

2個工作日

G04003

siRNA-Mate轉染試劑

1ml

1,500

2個工作日

G04008

GP-transfect-Mate

0.1ml

150

2個工作日

G04009

GP-transfect-Mate

1ml

1,500

2個工作日

E. 避免脫靶效應對照

對于RNAi研究來說,在哺乳動物中,脫靶效應是一個十分關注的問題。有大量的報道,一個siRNA影響多個基因的表達。因此,大量研究關注于用針對同一個基因的不同區域的多個siRNA進行實驗,然后分析各自對基因表達效果的影響。理想的結果是針對不同區域的siRNA對同一個靶基因產生相似的干擾效果。吉瑪公司的技術人員為您針對同一個靶基因設計多對siRNA oligos,為您解決脫靶效應的難題。

注: NC序列是大量文獻引用的一段序列,和所有的哺乳動物都沒有同源性,適用于大鼠、小鼠、人等不同基因的研究。

功能介紹與實驗實例

FAM-siRNA 對照產品的溶解及保存

1.1 由于OligoRNA很輕的干膜狀附在管壁上,打開時極易散失,所以打開離心管前先離心,然后再慢慢打開管蓋,溶解時加適量DEPC水后蓋上管蓋,振蕩溶解。

1.2? 1OD≈33ug≈2.5nmol為了得到20uM的濃度,應該使用125ul附送的DEPC水去重懸1OD的siRNA,溶解后為20uM的樣品。

1.3 貯存和穩定性:-20℃,熒光標記產品需要避光保存。液體(貯存濃度為20μM)溶解后分裝,避免反復凍融,3個月內用完;-20或者-80保存下siRNA oligo 干粉的穩定性可達到6個月,使用的管子、槍頭要無酶處理。

熒光標記的siRNA

轉染效率的高低可以通過熒光標記的siRNA(FAM-siRNA)實現。

FAM-siRNA 轉染細胞后,可以用熒光顯微鏡、激光共聚焦顯微鏡、流式細胞儀等檢測,確定是否有效轉染和優化轉染條件。FAM-siRNA 還可用作siRNA 胞內定位及雙標記實驗(配合標記抗體)來追蹤轉染過程中導入了siRNA 的細胞,將轉染與靶蛋白表達的下調結合起來。? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ??

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 圖1. FAM-NC轉染細胞后的熒光

? ? ? ??

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 圖2. CY3-NC轉染細胞后的熒光圖? ? ?

? ? ???

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 圖3. 以B為校準hACTB為內參hGAPDH基因表達水平

使用方法

A.siRNA轉染的方法
哺乳動物轉染的常見方法有:磷酸鈣共沉淀、電穿孔法、DEAE-葡聚糖和polybrene、機械法(例如,顯微注射和基因槍)、陽離子脂質體試劑,其中陽離子脂質體試劑轉染法是目前最常用的轉染方法。
應用脂質體型轉染試劑進行轉染需要注重的幾個方面:轉染試劑的用量、siRNA的用量、轉染時的細胞密度、轉染時的操作順序、細胞與轉染試劑/siRNA復合物的溫浴的時間


GP-transfect-Mate?操作流程(24?孔板)

24 孔板為例,若要檢測基因沉默或者過表達效果,推薦最低RNA oligo終濃度為50nM

DNA0.5~1.5μg);遵循以下操作方法可以高效地將RNA? oligo或者DNA轉染貼壁和懸浮培養的多種真核細胞。但是對某些特殊的細胞系和培養條件,或特殊應用等,也需要單獨特別優化,請參考表 1、表2

1.???????細胞鋪板

轉染時細胞密度:一般來說,當細胞密度達到60%80%時進行轉染可以取得較高的轉染效率(參見表1)。然而,不同細胞的最適轉染密度都不盡相同,因此在初次轉染某種細胞時,可以通過預實驗先確認該細胞最佳的轉染密度。

2.?轉染復合物的制備

1)將 GP-transfect-Mate轉染試劑放置于室溫中,使用前輕輕混勻。

2)在1.5 ml無菌離心管中加入50 μl無血清培養基或 OPTI-MEM,并添加適量的轉染試劑(參見表2),用移液器輕輕混勻,室溫靜置5 min

3)同時在另一1.5 ml無菌離心管中加入50 μl無血清培養基或 OPTI-MEM,并添加適量的RNA oligo/DNA (參見表2),用移液器輕輕混勻,室溫靜置5 min

4)將GP-transfect-Mate-培養基混合物滴加至RNA oligo/DNA-培養基混合物中,用移液器輕輕混勻,室溫靜置15-20 min 后,立即轉染。

注:復合物盡量在60 min內使用,并且GP-transfect-Mate-培養基混合物和RNA oligo/DNA-培養基混合物的混合次序非常重要,切勿顛倒。

3.?轉染過程

1)趁靜置時,給 24 孔板換液,每孔換上 0.4ml 預熱的新鮮培養基。

2)將 100 μl 轉染混合物加入孔中,終體系為500 μl。加完后將板輕輕晃動以使復合物均勻分布。

337℃靜置培養細胞,4-6h換成完全培養基。24-72 h檢測mRNA表達,48-96 h檢測蛋白表達。


適用范圍

293T, A549, Beas-2B,HeLa,ECA-109,Raw264.7,A375,CAFs,HCT116,HT29,LMH,NE-4C,MGC803,PC-3, PC-12MCF-7,C6等細胞。

?1:?貼壁細胞或懸浮細胞接種數量、培養基體積

培養器皿

每孔表面積(cm2

每孔培養基的體積(ml

貼壁細胞轉染前一天接種密度

懸浮細胞轉染當天接種密度

96?孔板

0.3

0.1

5 000±2 500

2-5×104

24?孔板

2

0.5

25000±10 000

1-2.5×105

12?孔板

4

1

50000±20 000

2-5×105

6?孔板

10

2

150000±50 000

0.4-1×106

60mm

20

4

400000±100 000

1-2.5×106

100mm

60

10

1*106±250 000

2-5×106

注:貼壁細胞培養密度取決于培養器皿的表面積,而懸浮細胞則由培養基的體積決定。

?2?不同培養板轉染DNA/RNA??oligo的推薦轉染條件

培養器皿

Growth

Medium

Opti-MEM/ Serum-free Mediumfor complex

DNA?轉染

RNA轉染

DNA/μg

轉染試劑/μl

RNA/pmol

轉染試劑/μl

96?孔板

100 μl

2×10μl

0.2

0.4-1

20

0.5-1

24?孔板

500 μl

2×50μl

0.6

1.2-3

40

1-3

12?孔板

1ml

2×100μl

1.5

3-6

80

3-5

6?孔板

2 ml

2×200 μl

3

6-12.5

150

5-8

60mm

5ml

2×500 μl

6-10

12-20

300

10-20

100mm

10 ml

2×1ml

15-30

30-60

500

25-35

注:GP-transfect-Mate轉染試劑的用量在此范圍內進行優化。




B.Lipofectamin2000 轉染試劑

選擇最適合的轉染試劑和轉染條件,往往取決于不同的哺乳動物細胞類型和不同的核酸分子。Lipofectamin2000適用于核酸的體內和體外操作,可應用于DNA、RNA、反義寡核苷酸、siRNA的轉染,也可應

用于DNA/siRNA的共轉染操作;是一種新型的高效siRNA轉染試劑。


Lipofectamin2000的應用領域:

1、原代培養細胞和轉化細胞株的基因轉染
2、siRNA高通量轉染試驗
3、DNA轉染;DNA和siRNA的共轉染
4、核酸(siRNA、DNA、RNA)的體內導入試驗
5、貼壁細胞和懸浮細胞轉染


Lipofectamin2000 的特點:?

1、不必更換培養基,操作簡便易行,可在半小時內完成操作
2、在含血清培養基中也能表現高轉染效率
3、細胞毒性低;適用細胞廣泛
4、即用型試劑,可在含有抗生素的完全培養基中轉染
5、基于脂質的轉染試劑,確保沒有RNAse活性
6、可介導siRNA高轉染細胞及體內siRNA的高效導入


C. Lipofectamin2000適用的細胞類型

Lipofectamin2000轉染試劑可廣泛應用于多種細胞系的DNA和siRNA轉染如:HeLa(人頸部癌細胞)、MCF-7(人乳房癌細胞)、Hep3B(人肝細胞癌細胞)、COS-7(猴腎細胞)、Neuro-2a(鼠神經母細胞瘤細胞)、NIKS(人角質化細胞)、B16(鼠黑素瘤細胞)、DLD-1(人結腸癌細胞)、NIH/3T3(鼠胚胎成纖維細胞)、HT-29(人結腸腺癌細胞)、A549(人肺癌細胞)、CHO-k1(倉鼠卵巢細胞)和293(腺病毒5 DNA轉化的人胚胎腎細胞),SVRbag4細胞等。


D.轉染前細胞培養

在細胞板上培養細胞時,應使細胞匯合在24小時內達到70-90%。


E.合適的lipofectamin2000用量

合適的siRNA(DNA):lipofetamin2000比例對核酸的高效轉染有重要影響;我們推薦的DNA:lipofetamin2000為1:0.5—1:5(ug:ul),siRNA:lipofectamin2000為1:0.01-1:0.1(pmol:ul)一般情況下,此范圍內都可獲得高的轉染效率。



F.貼壁細胞轉染程序

選用生理狀態良好的細胞對提高轉染效率很重要。siRNA(DNA)和lipofectamin的用量和兩者的比例可在推薦范圍內適當調整。

1、轉染前一天,4-5′104細胞接種在24孔板上, 0.5mL含FBS和抗生素的DMEM(或Opti-MEM,其他培養基)細胞培養基。
2、選擇用于初期接種的細胞數量,應能在24小時內使細胞匯合達到70-90%。
3、在50μl的DMEM(或Opti-MEM,或其他無血清培養基)無血清培養基加入20pmol siRNA(或0.8μg DNA),柔和混勻;
4、混勻lipofectamin試劑,用50μl無血清的DMEM或Opti-MEM,或其他無血清培養基)稀釋1μl lipofectamin試劑(DNA轉染時,則加入2μllipofectamin試劑),輕輕混勻,室溫放置5分鐘;

5、將稀釋好的siRNA和RNAi-Mate試劑混合;輕柔混勻,室溫放置20分鐘,以便形成siRNA/lipofectamin(或DNA/lipofectamin)復合物。
6、將100μl siRNA/lipofectamin(或DNA/lipofectamin)復合物加到含有細胞和培養基的培養板的孔中,來回輕柔搖晃細胞培養板板。
7、 細胞在CO2培養箱中37℃溫育24h-48h后,進行轉染后的其它檢測步驟。如果細胞株比較敏感,孵育4-6小時后,除去復合物,更換培養基。 ?


G.懸浮細胞轉染程序

1、轉染的當天,收集細胞離心,用含FBS的培養基重懸。
2、在50μl的DMEM(或Opti-MEM,或其他無血清培養基)無血清的培養基加入20pmol siRNA(或0.8μg DNA),柔和混勻;
3、混勻lipofectamin試劑,用50μl無血清的DMEM或Opti-MEM,或其他無血清培養基)稀釋1μl lipofectamin試劑(DNA轉染時,則加入2μl lipofectamin試劑),輕輕混勻,室溫放置5分鐘;
4、將稀釋好的siRNA和lipofectamin試劑混合;輕柔混勻,室溫放置20分鐘,以便形成siRNA/lipofectamin(或DNA/lipofectamin)復合物。
5、再加入400μL細胞懸浮液(細胞數量決定于細胞類型和轉染后分析測試的時間)。
6、細胞在CO2培養箱中37℃溫育24h-48h后,進行轉染后的其它檢測步驟。如果細胞株比較敏感,孵育4-6小時后,除去復合物,更換培養基。 ?



H.DNA和siRNA共轉染細胞

1、在轉染的前一天,4-5′104細胞接種在24孔板上,0.5 mL含FBS和抗生素的細胞培養基。
2、選擇用于初期接種的細胞密度,應能在24小時內使細胞匯合達到70-90%。
3、在100μL的無血清的培養基中稀釋20pmol siRNA和0.2μg DNA,加入2μl lipofectamin試劑,充分混合,放置20分鐘,以便形成siRNA/ DNA/lipofectamin復合物。
4、將siRNA/ DNA/lipofectamin復合物加入培養基中,輕輕混勻。
5、細胞在37℃溫育24h-48h后,進行轉染后的其它步驟。


I.siRNA體內導入方法

1、適量的siRNA或DNA溶于不含RNA酶的無菌水中,輕輕混勻,因為注射液體積有限,建議采用高濃度的siRNA或DNA,一般DNA為2μg /μL、siRNA為10μg /μL。
2、取適量的DNA、siRNA或siRNA\DNA復合物與lipofectamin混合。例如,在1#管中加入0.5μL的DNA(1μg)和0.5μL的siRNA(5μg),在2#管中加入0.55μL的lipofectamin(24μg)和0.45μL不含RNA酶的無菌水中,將1#管中的溶液加入2#管中,在室溫下溫育30分鐘,以形成siRNA/DNA-lipofectamin復合物。
3、制備的siRNA/DNA-lipofectamine復合物可用于體內導入siRNA、DNA或siRNA\DNA。

產品說明書

相關文獻

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目錄分類 本商品目錄中的產品介紹按以下內容分類:

1. RNA干擾研究工具
2. MicroRNA研究工具?

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